Conservación 
 Anillamiento 
 Bibliografía 
 Divulgación 
 Proyecto ARQE  
La SECEMU desarrolla diferentes trabajos como el Atlas de distribución de especies, Inventario de refugios, asesoramiento a la administración en temas de conservación, anillamientos, denuncia de atentados contra la supervivencia de los murciélagos o campañas de sensibilización. Para el desarrollo de estos trabajos no cuenta con personal liberado sino que son los propios socios de forma voluntaria y organizados y coordinados por comisiones los que se responsabilizan de diferentes proyectos o temas dentro de la Sociedad.